حاليًا، تحتضن الكلية الوطنية للهندسة في سوسة (ENISo) ثلاثة مختبرات: مختبر ميكانيكا سوسة (LMS)، ومختبر التكنولوجيا المتقدمة والأنظمة الذكية (LATIS)، ومختبر أجهزة الشبكة وأنظمة التحكم والاتصالات (NOCCS). يقوم الثلاثة مختبرات بأبحاثها في التخصصات المكملة لـ ENISo، وهي الميكاترونيات، وإنتاج الآلات، والإلكترونيات المضمنة، وعلوم الحاسوب وتكنولوجيا المعلومات.
تمتلك هذه المختبرات الوسائل اللازمة لإتمام برامجها البحثية بنجاح. تكون هذه البرامج منظمة في مشاريع تحتوي على أهداف واضحة ومستهدفة تلبي الأولويات الوطنية.
تُعتبر البحث التطبيقي ضروريًا في ENISo مع تحقيق نتائج ملموسة وملموسة. يُولي أولوية للبحث الذي يتم بالتعاون مع الصناعة وخاصةً إذا كانت تمول جزءًا من الصناعة.
تتبنى المدرسة استراتيجية واضحة للبحث، وتكون أهداف كل مختبر واضحة ومتناغمة مع أعمال الرسائل العليا والماجستير في البحث. من خلال التعاون مع لجان الرسائل العليا والماجستير، وكذلك مع المدرسة الدكتوراه في العلوم والهندسة، يتم مواءمة مشاريع البحث مع الأهداف الوطنية وتلك التي تخص المدرسة بشكل خاص.